“小吴，任务‘跑’得咋样了？”一大早，北京生命科学研究所实验室主任黄牛博士就出现在实验室门口，满怀希望地看着研究助理小吴。

实验室向中科院超算中心的深腾7000超级计算机提交了8项模拟计算任务，模拟计算禽流感病毒血凝素蛋白侵染人体的三维变化过程。他们管这种计算过程叫“跑”，按计划在这两天将结束运算。

小吴打开电脑，远程登录中科院超算中心的服务器，输入查询命令后马上得到系统的反馈——6项任务已经在一周的时间里完成，还剩最后2项任务有望在当天夜里“跑”完。

这个仅仅一周就完成的“短跑”，只是一个查遗补缺的过程。此前的一年多，实验室借助中科院超算中心，已经完成了无数次需要两周甚至更长时间才能完成的“长跑”。

再完成几次“短跑”后，黄博士领衔的团队将把研究成果撰写成论文。这项已经酝酿了三年的科研课题，因为有中科院和本市的合作协议作支持，在最近一年多得以付诸实施，胜利的曙光已经微露。

黄博士所在的实验室，有一个研究领域是通过模拟细胞内生物大分子靶点在不同环境下的运动轨迹，来研究引起病变的原因，并就此研发有治疗潜力的药物，但经常一个模拟过程就需要进行上亿次的计算。“打个简单的比方，就像是用高速摄影机拍摄电影，可能甚至需要拍摄上亿个画面才整合出来一个完整的故事。这个计算过程如果用一台目前主流的个人电脑（PC机）需要几年，甚至几十年。”黄博士说，没有运算速度惊人的超级计算机，是无法完成一系列模拟任务的。

但是，生命科学研究所到哪儿去找一台超级计算机呢？

2007年底，黄博士在国内搜寻了一圈，也没有发现符合要求的超算服务机构。他不得已购买了40台PC机，攒成一个“DIY超级计算机”，后来又购买了200个有多核处理器的计算服务器。即使这样，速度还是不能满足对血凝素蛋白进行大尺度模拟的要求，只能做一些相对简单的运算。

转机发生在2009年。

那一年的6月，中科院与本市签署共建“首都科技条件平台”协议。中科院计算机网络信息中心、电工所等单位先后加入首都科技条件平台，一大批仪器设备、科研成果走出“深闺”，向北京企业和院所开放。由此，中科院超算中心拥有的国内第一台投入使用的百万亿次超级计算机——深腾7000，向北京企业、科研院所敞开了大门。

“我们是深腾7000面向社会开放后的第一批用户，用这个‘大家伙’模拟一次禽流感血凝素蛋白的运动，通常两周就能结束。”黄博士说，经过一年多的模拟研究，研究团队初步发现了可以调控血凝素蛋白三维变化的关键部位，可以据此研发出抑制病毒的药物。

目前，深腾7000已经达到了满负荷运转，其中一半多的任务来自院外。任务多时，还需要“排队”。

截至2010年底，中科院已有计算所、过程工程所等18家下属单位加入首都科技条件平台，将累计20亿元的仪器设备、近百项最新优秀科研成果向北京企业和院所开放，占首都科技条件平台总量的两成多，共为1500多家企业提供了5594次的服务，中科院和企业合作项目超过60项。一大批中关村企业和研发机构借力中科院的资源，开展研发科研工作。

（来源：北京日报）